Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pole2O54956 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms