Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Lgals6O54891 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms