Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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DffaO54786 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffaO54786 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms