Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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