Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms