Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Casq1O09165 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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