Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Degs1O09005 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Degs1O09005 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Degs1O09005 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Degs1O09005 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Degs1O09005 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms