Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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