Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm13494-201ENSMUST00000120828 1096 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Retnlg-201ENSMUST00000065666 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tctex1d2-202ENSMUST00000080316 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Gm21887J3QQ04 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 4930511A02Rik-201ENSMUST00000181268 1935 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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