Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms