Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21746J3QMM6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms