Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm20834J3QM72 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20834J3QM72 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms