Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm20830J3KML6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm20830J3KML6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm20830J3KML6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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