Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms