Protein–RNA interactions for Protein: F6ZED4

Gm9970, Predicted gene 9970, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9970F6ZED4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm9970F6ZED4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm9970F6ZED4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm9970F6ZED4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9970F6ZED4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms