Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms