Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc175E9PVB3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms