Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms