Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm4787B2RUD9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms