Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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