Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms