Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm6880A3KG45 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms