Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Samt1A2BED8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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