Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms