Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms