Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms