Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ubl3Q9Z2M6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ubl3Q9Z2M6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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