Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms