Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefQ9JLC6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms