Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms