Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ldb3Q9JKS4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms