Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ap3m1Q9JKC8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms