Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zcchc17Q9ESX4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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