Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms