Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xab2Q9DCD2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms