Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Syde1Q9DBZ9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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