Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms