Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf138rt1Q9D9M9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms