Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg7Q9D906 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg7Q9D906 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg7Q9D906 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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