Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B4

Ndufa11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa11Q9D8B4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.7 ms