Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms