Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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Borcs6Q9D6W8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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Borcs6Q9D6W8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Borcs6Q9D6W8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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Borcs6Q9D6W8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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Borcs6Q9D6W8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Borcs6Q9D6W8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Borcs6Q9D6W8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Borcs6Q9D6W8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Borcs6Q9D6W8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms