Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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