Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms