Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Stx17Q9D0I4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx17Q9D0I4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms