Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms