Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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