Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF4

Tbc1d15, TBC1 domain family member 15, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d15Q9CXF4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tbc1d15Q9CXF4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tbc1d15Q9CXF4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tbc1d15Q9CXF4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tbc1d15Q9CXF4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tbc1d15Q9CXF4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms