Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms