Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms